提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

台湾2022年气温持续偏暖 南部雨量近30年来最少******

　　中新社台北12月30日电 台湾气象部门30日表示，2022年台湾气温持续偏暖，雨量呈现北多南少的状况，南部雨量出现近30年以来最少。

　　综合中央社、中时电子报等台湾媒体报道，台“中央气象局”预报中心主任吕国臣介绍，截至12月27日，2022年全台11站平均气温为24.1摄氏度；气候特征为春季正常偏暖，梅雨季偏冷且降雨集中，夏季高温少雨，侵台台风偏少，秋冬季先暖后冷。整体而言，各地气温偏暖。

　　数据显示，今年台湾雨量呈现北多南少的状况，南部的台南、恒春及大武站平均雨量只有1299毫米，创下近30年来最少纪录。

　　台“中央气象局”表示，目前中、东太平洋的冷海温逐渐减弱，预测拉尼娜现象将持续到明年春季后恢复正常，研判明年第一季台湾各地平均气温正常的概率较大，雨量为正常到偏少。

　　该部门还提醒，适值台湾南部水库水位大多偏低，呼吁民众爱惜水资源、注意节约用水，同时提醒每年1月和2月是最冷的月份，冬季平均气温即使偏暖，仍间有低温出现，应适时做好御寒措施。(完)